Ефим Моисеевич работал в Киевском политехническом институте с 1965 года: был на разных инженерных должностях, руководителем групп, старшим научным сотрудником кафедры радиоприемных устройств РТФ.
С 1972 по 1975 год заведовал проблемной лабораторией гидроакустики, на базе которой и было создано уникальное ОКБ «ШТОРМ».
В ОКБ «ШТОРМ» Лимонник бессменно работал с 1975 года до последних дней своей жизни в должностях начальника лаборатории, заместителя и начальника НИО, и.о. заместителя директора ОКБ.
За 57 лет работы в КПИ Ю. М. Лимонник разработал целый ряд уникальных устройств измерения и обработки гидроакустических сигналов, участвовал и являлся ответственным руководителем многих научно-исследовательских и конструкторских работ военного и гражданского назначения, автором ряда научных работ и изобретений, членом научно- технического совета ОКБ "Шторм" и научно-технического совета ФТИ.
За трудовую деятельность награжден несколькими медалями и многочисленными наградами.
КПИ им. Игоря Сикорского выражает искреннее соболезнование близким и родным по поводу смерти Ефима Моисеевича.
Прощание с Ефимом Моисеевичем Лимонником состоится на Байковом кладбище 10 мая 2022 в 14 часов у здания крематория.